般把一次PCR扩增只能运行一个特定退火温度的PCR仪，称之为普通PCR仪。如果要用它做不同的退火温度则需要多次运行。主要是用作简单的，对目的基因退火温度的扩增。
　　主要应用于科研、教学、临床医学、检验、检疫等。
　　梯度PCR仪
　　一次性PCR扩增可以设置一系列不同的退火温度条件（通常12种温度梯度）的称之为梯度PCR仪。因为被扩增的不同的DNApian段其最适合的退美国ABI 9700 普通PCR仪火温度不同，通过设置一系列的梯美国ABI 9700 普通PCR仪度退火温度进行扩增，从而一次性PCR扩增就可以筛选出表达量高的最适合退火温度进行**的扩增美国ABI 9700 普通PCR仪。主要用于研究未知DNA退火温度的扩增，这样既节约时间，也节约经费。在不设置梯度的情况下亦可当做普通的PCR用。正真的梯度，是每一排管都有精确的加热控温探头，2009年为止只有美国ABI公司可以做到。美国ABI 9700 普通PCR仪其他的都是从两头的热传递来设计控温。
　　梯度PCR仪多应用于科研、教学机构。
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